Разве пределы производительности процессора меняются в зависимости от теплоотвода? По-моему не здесь причина.

А эта особенность теперь постоянна? Может какая-нибудь фоновая программа решила себя проявить? Антивирусное сканирование, скачивание каких-нибудь обнов, вирусы?
По диспетчеру задач проверял, что именно нагружает?